保護區設立前，黃巖島在行政歸屬上屬于海南省三沙市管轄，但三沙市的行政區劃并未覆蓋到黃巖島的具體行政管理。

2025年9月10日，自然資源部提報申請，國務院批準，合規合法，黃巖島地處中沙群島，距離海南島約900公里，距離菲律賓呂宋島約200公里，是一個面積約150平方公里的環形珊瑚島礁。

國際環保法規給主權主張提供了一個新的支點，以環境保護為名義，在爭議海域展開行政管轄，這在法律上很難被直接反駁，中國不是直接宣布軍事管制或排他性警戒區，而是通過設立國家級自然保護區，將黃巖島納入國內環保法律體系。

菲律賓的反應很快，保護區獲批后第六天，2025年9月16日，菲方組織10余艘公務船從不同方向侵闖黃巖島領海，其中3014號公務船以危險方式故意沖撞中方執法船。

2025年8月11日，菲方以“給漁船運補”為幌子，組織多艘海警船和公務船侵闖黃巖島附近海域，同時軍機侵闖黃巖島領空，2025年11月22日，菲律賓漁業和水產資源局公務飛機攜帶記者赴黃巖島附近挑事。

美國也表態了，2025年9月12日，美國國務卿馬爾科·盧比奧發表聲明，稱美國“拒絕中國設立自然保護區的破壞穩定的計劃”，并敦促中國遵守2016年南海仲裁案裁決，中方立即提出嚴正交涉。

2025年12月8日，中國常駐聯合國副代表孫磊在聯大發言中明確表示，“南海仲裁案”是一出披著法律偽裝的政治鬧劇，違反國際法基本原則，所作裁決非法無效，中方不接受、不承認。

馬尼拉的抗議持續不斷，中國海警的巡航卻一天沒停，2026年1月30日，中國海警局局長張建明在《海警法》實施五周年海上執法專題訪談中透露，五年來中國海警常態化開展東海、南海定期維權巡航，也包括黃巖島領海及周邊區域執法管控。

2025年6月30日，中國海警在黃巖島領海執法巡查，2026年4月17日，海警川山艦完成黃巖島海域常態化巡航值守任務，巡航不是偶爾的展示，而是按計劃執行的例行部署，中方的邏輯很清楚：保護區在法律上確立了行政管理權限，海警巡航是行使管轄權的具體體現。

2026年6月1日，美國海岸警衛隊首次參與美菲在黃巖島附近海域的聯合行動，軍事專家張軍社當天評論道，美菲聯合巡航區域實際上更靠近呂宋島一側，距離黃巖島較遠，表演性質大于實際意義。

如果說海警執法讓黃巖島從“存在爭議”變成了“存在管控”，那么南部戰區的戰備警巡就是讓美國的軍事回應從“可能”變成了“不可能”，2025年11月29日，南部戰區組織海空兵力在黃巖島領海領空及周邊區域開展戰備警巡。

自11月起，戰區部隊持續強化黃巖島領海周邊巡邏警戒，2025年12月31日，在這一年的最后一天，南部戰區再度通報戰備警巡情況，彰顯守護海疆的堅定決心。

時至2026年5月31日，局勢愈演愈烈，就在當日，菲律賓與美國海岸警衛隊相互勾結，在黃巖島附近開展所謂的“海上聯合行動”。就在同一天，南部戰區出動052D型驅逐艦、054A型護衛艦、056A型護衛艦，以及轟-6K、殲-16等多型戰機，在黃巖島領海領空開展戰備警巡。

轟-6K掛載鷹擊-12反艦導彈進入巡航陣位，海警船多艘以編隊形式巡航，同一天的軍事信號極其明確，執法與軍事兩個層級同步推進，不留任何行動空間給對手。

這是菲律賓和美國最絕望的地方，對抗環保法規，國際社會不會跟著走，對抗海警執法，中國有《海警法》和國內法律作支撐，對抗解放軍戰備警巡，中國軍隊在自己的領海領空行使主權，每一招都卡在國際法的合法框架之內，每一招都讓對方找不到反制的突破口。

菲律賓多次侵闖、多次抗議、多次拉攏美國搞“聯合巡航”，從2025年8月到2026年5月，從公務船沖撞到軍機侵闖再到美國海岸警衛隊首次下場，每一次挑釁都被同步壓制。

中方回應的措辭高度一致：黃巖島是中國固有領土，中國有權在自己領海內采取一切合法措施，南部戰區新聞發言人在多個場合強調，戰區部隊將堅決捍衛國家領土主權和海洋權益。

當自然保護區把行政管轄權固定下來，當海警把執法巡航變成日常秩序，當軍隊把戰備警巡鑄成銅墻鐵壁，整件事情就成了一道無解的陽謀。

菲律賓抗議了一次又一次，美國表態了一次又一次，沒有哪條抗議能讓中國的海警船從黃巖島撤走，沒有哪份聲明能讓解放軍的轟-6K從天上消失。

面對這樣一道題，菲律賓的出路只有一條：接受現實，承認黃巖島屬于中國，回到雙邊談判桌上解決分歧，除此以外，別無他法，黃巖島已經是中國的，而且從未如此穩固地握在手里。