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導致艾滋病的HIV病毒是個高手,它憑借自身編碼的9個蛋白,就可以劫持T細胞為自己所用。
雖然距離人類首次發現HIV感染已經快過去50年了,但是科學家仍未解開究竟哪些人類基因會影響HIV感染。
今天,由美國格拉斯通研究所和加州大學舊金山分校Alexander Marson和Ujjwal Rathore領銜的研究團隊,在頂級期刊《細胞》上發表一篇重要研究論文[1]。
他們借助于CRISPR基因編輯技術,繪制出了首個完整的HIV與人類T細胞相互作用的基因圖譜,分別篩選到約200個抗病毒因子和促病毒因子,為理解和防治HIV感染打開了新思路。
他們重點驗證了PI16和PPID等之前未被發現過的抗病毒蛋白,PI16可干擾病毒與T細胞融合,PPID則能與HIV衣殼結合并抑制其進入細胞核;其中,PPID是研究中發現的最強效新型抗病毒因子。
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在人體內,HIV主要感染CD4陽性T細胞,然而之前的大多數研究都是在實驗室的“永生化”細胞(它們其實是癌細胞)系中開展的,很難反映HIV感染的真實情況。
之前的研究之所以鮮有在真正的人T細胞中開展,是因為想讓HIV感染T細胞并不容易。為了克服這個問題,Marson/Rathore團隊都花了數年時間[2]。
在解決體外培養感染問題之后,他們設計了兩種CRISPR基因編輯技術:CRISPRn(敲除)和CRISPRa(激活/過表達)。他們希望借助于這兩種互補的技術,盡可能地篩選到調節HIV感染T細胞的所有因子。
從篩選結果來看,CRISPRn篩選到了48個抗病毒因子(這些基因被敲除后會導致HIV感染率上升),以及61個促病毒因子(這些基因被敲除后會使HIV感染率下降);CRISPRa篩選到更多,173個抗病毒因子和240個促病毒因子。在所有重疊的因子中,僅有一個作用結果不一致,其余全是一致(相當于互相佐證了)。
在上述所有因子中,Marson/Rathore團隊重點關注了兩個強效抗病毒因子——PPID和PI16,證實二者能夠有效抑制包括原始臨床分離株(BaL、SF33等)在內的多種HIV毒株。
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在后續研究中,研究人員分別探索了PI16和PPID的抗病毒機制。簡單來說,PI16與一系列參與HIV融合的蛋白發生物理相互作用,從而抑制HIV生命周期中的這一步驟,保護CD4陽性T細胞免受感染;如果讓PI16過表達,可以將HIV感染率降低10倍以上。
作為最強的新型抗病毒因子PPID,CRISPRn和CRISPRa都篩選到了它。PPID通過模仿促病毒因子CypA的結合方式鎖定病毒衣殼,但隨后利用其特有的TPR結構域招募TOM70等宿主因子,從而將原本輔助病毒感染的衣殼位點,轉化為限制病毒核心進入細胞核的“陷阱”。
值得注意的是,基于分子進化的研究發現,PPID在靈長類動物中經歷了正選擇,許多非人靈長類(如獼猴、卷尾猴)的PPID版本比人類的限制能力更強。顯然,這一發現有助于開發更強效的抗HIV藥物。
總的來說,格拉斯通研究所的研究人員利用全基因組CRISPR技術,系統性地鑒定了調節人類原代CD4陽性T細胞中HIV感染的促病毒因子與抗病毒因子,并深入分析了其中兩個強效抗病毒因子。這項工作不僅描繪了HIV與宿主相互作用的功能景觀,還為開發基于宿主通路的新型抗病毒療法提供了科學依據。
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參考文獻
[1].Rathore et al., Systematic discovery of pro- and anti-HIV host factors in primary human CD4+ T cells, Cell (2026), https://doi.org/10.1016/j.cell.2026.03.046
[2].https://gladstone.org/news/scientists-map-how-hiv-hijacks-human-cells-and-how-cells-can-fight-back
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本文作者丨BioTalker
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