上海
在組織病理學中，免疫組化是廣泛使用的診斷和檢測方法，過去幾十年里，這種基于抗體的技術被認為是癌癥診斷的金標準工具，為各種腫瘤的免疫治療提供有價值的信息。然而免疫組化存在①主觀因素造成的不同判別差異，②定量的不精確性和檢測靶標數量有限等不足。這些局限性導致對復雜的腫瘤微環境中無法進行更深層次的研究。
在這種背景下，多重免疫組化和多重免疫熒光技術應運而生，并得到越來越多地關注。2026年3月，王光川、陳洛南、景乃禾等團隊合作在Cell雜志發表題目為CLIM-TIME identifies metastatic microenvironment modulators for T cell therapy response的論文。該研究解決腫瘤免疫領域長期存在的痛點：如何高通量、因果性地解析腫瘤抑制基因（TSG）缺失如何重塑轉移性微環境，進而決定 T 細胞治療的響應？
過去看腫瘤微環境，多是相關性分析，看到某種基因突變伴隨某種免疫表型，但很難說清誰是因、誰是果。而CLIM-TIME平臺通過整合CRISPR篩選、激光捕獲顯微切割（LCM）和空間轉錄組技術，真正實現了從基因型到免疫表型的因果映射。
傳統的CRISPR篩選往往是將整個腫瘤打碎測序，丟失了空間信息。CLIM-TIME利用熒光標記的單克隆轉移灶，結合LCM技術，精確捕獲3000多個獨立的轉移克隆進行SMART-seq測序。這不僅保留了sgRNA信息，還獲得該克隆及其周圍微環境的完整轉錄組。
基于這種高精度的數據，研究人員沒有籠統地談冷或熱腫瘤，而是精細地定義七種轉移性TME亞型。從CD4/CD8雙浸潤型，到髓系富集但T細胞排斥型（M-II/T-IE），再到免疫荒漠型。這種分類讓我們看到，不同的TSG缺失（如DNA修復基因 vs. Hippo通路基因）會驅動截然不同的轉錄程序，塑造出完全不同的免疫生態位。
表型層面。研究發現，DNA損傷修復（DDR）和Polycomb復合物（PRC） 基因的缺失，傾向于形成T細胞浸潤型TME，這類腫瘤對T細胞治療敏感。相反，Hippo-YAP通路（如Nf2, Lats1/2）基因的缺失，則強力驅動免疫逃逸，形成髓系富集、T 細胞被物理排斥的冷腫瘤，導致治療抵抗。
機制層面。研究鎖定關鍵效應分子，LOXL2（賴氨酰氧化酶樣蛋白2）。YAP可直接結合并上調Loxl2表達。LOXL2作為交聯酶，可催化膠原蛋白的過度交聯，導致ECM硬度增加、致密化。
轉化層面。抑制LOXL2（使用抑制劑PXS5505）聯合 T 細胞治療（如CAR-T），在多種難治性轉移模型中均能顯著延長生存期。這為克服實體瘤免疫治療抵抗提供一個極具前景的聯合策略：降解ECM+T 細胞治療。
這項研究創造性地將體內CRISPR篩選與空間分辨的轉錄組學結合起來。以前的篩選只能提示哪個基因重要，CLIM-TIME則全面呈現這個基因缺失后，腫瘤長什么樣、周圍有什么細胞、細胞間怎么對話。這是一種范式轉移，為研究基因型-微環境互作樹立了新標桿。
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