近年來(lái)，低生物量瘤內(nèi)微生物群落已被逐漸認(rèn)識(shí)為腫瘤微環(huán)境不可忽視的組成部分，尤其是在結(jié)直腸癌（CRC）中，特定促癌菌群的富集可通過(guò)誘導(dǎo)DNA損傷、錯(cuò)配修復(fù)紊亂、表觀遺傳重編程、慢性炎癥及免疫逃逸等多重機(jī)制影響腫瘤進(jìn)展。然而，盡管微生物與宿主的相互作用日益受到關(guān)注，現(xiàn)有研究大多停留在“哪些菌富集”或“哪些通路改變”的相關(guān)性描述層面，針對(duì)瘤內(nèi)微生物如何系統(tǒng)性地重塑宿主基因轉(zhuǎn)錄網(wǎng)絡(luò)及免疫微環(huán)境，仍缺乏機(jī)制層面的深入闡釋。與此同時(shí)，傳統(tǒng)病例-對(duì)照框架難以解釋不同研究間的高度異質(zhì)性，而基于腸型（enterotype）等離散分類(lèi)的策略也未能刻畫(huà)真實(shí)微生態(tài)系統(tǒng)中持續(xù)變化、狀態(tài)重疊及個(gè)體差異顯著的特征。如何突破“菌群組成差異”的表層描述，建立從微生物到宿主基因調(diào)控的功能性因果鏈路，已成為當(dāng)前腫瘤微生態(tài)研究的重要挑戰(zhàn)。

近日，廈門(mén)大學(xué)附屬中山醫(yī)院任建林、許鴻志團(tuán)隊(duì)與香港中文大學(xué)張翔團(tuán)隊(duì)在CellReports上發(fā)表題為Integrative analysis reveals intra-tumoralmicrobialenterotypesshape host transcriptomes in colorectal cancer的研究論文，系統(tǒng)性揭示了瘤內(nèi)微生物組與結(jié)直腸癌宿主基因之間的功能調(diào)控關(guān)系，并提出基于微生物-基因互作的新型分子分型策略。

研究團(tuán)隊(duì)對(duì)配對(duì)腫瘤與正常組織161個(gè)樣本進(jìn)行了整合多組學(xué)分析，識(shí)別出涉及30個(gè)細(xì)菌類(lèi)群的4197對(duì)顯著的細(xì)菌-基因互作對(duì)。通過(guò)基于這些互作模式的患者分層，團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)了兩種具有不同微生物特征和免疫譜的分子亞型，提示瘤內(nèi)微生物可直接重塑宿主的轉(zhuǎn)錄程序。在機(jī)制層面，研究進(jìn)一步鎖定關(guān)鍵致病菌——脆弱擬桿菌（Bacteroides fragilis）。小鼠模型實(shí)驗(yàn)表明，該菌能夠顯著改變腫瘤免疫微環(huán)境，通過(guò)促進(jìn)髓源性抑制細(xì)胞（MDSC）介導(dǎo)的 CXCL2信號(hào)通路及ROS產(chǎn)生，直接抑制CD8+ T細(xì)胞的活化并誘導(dǎo)其進(jìn)入耗竭狀態(tài)，從而驅(qū)動(dòng)腫瘤免疫逃逸。本研究討論了瘤內(nèi)微生物和宿主基因表達(dá)的關(guān)系，揭示了微生物-免疫互作軸，有望成為CRC新型治療策略。該工作不僅為理解瘤內(nèi)微生物如何“編輯”宿主免疫反應(yīng)提供了機(jī)制層面的新范式，也為結(jié)直腸癌的微生物組靶向治療和免疫分型策略奠定了重要基礎(chǔ)。

本研究由廈門(mén)大學(xué)附屬中山醫(yī)院任建林、許鴻志團(tuán)隊(duì)與香港中文大學(xué)張翔團(tuán)隊(duì)合作完成。廈門(mén)大學(xué)附屬中山醫(yī)院任建林教授、許鴻志教授、杜丹教授與香港中文大學(xué)張翔教授為該論文的通訊作者，博士后袁鎧，連一帆為共同第一作者。

原文鏈接：https://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(26)00491-2

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