河北
昨天的文章“為什么你的身體沒裝’發電廠‘？”，我們講了兩個板塊，其中第二塊是進化的內容，涉及到內共生了，今天就專門用一篇來和大家聊聊內共生學說。
01，關于內共生學說
關于內共生學說，相信大家都有所了解，簡單地說就是long long ago，一個產生ATP特別活躍的細菌被另一個菌吞噬，然后二者從此過上了幸福的生活。時間久了，被吞進去的那個功能越來越弱化，最后成為負責能量產生的細胞器，而它的其他需求由吞噬者提供。
這個學說強大到什么地步？
至少在近兩年之前，它是判斷真核生物和原核生物的標準之一！長期以來被認為是真核生物必不可少的細胞器之一。
02，內共生大概什么時候發生的？
內共生發生在大概什么時候呢？這個目前沒有太確切的證據，大概推測應該在氧氣代謝出現的那個時代，15億-26億年。因為我們在線粒體跨物種進化上，有點卡殼。
原因如下，
1，線粒體內共生過程中，應該發生了基因的突變→假基因化→缺失/轉移。
當然線粒體也接受了來自基因組上的基因
這就導致我們不容易追溯這個過程，畢竟跨物種進化這么多年做的也不是特別快。
不像我們做進化，只追蹤個別基因即可。
2，線粒體本身進化呈現了
兩個截然不同的方向。即小基因化和大基因化。
向小基因組進化主要以動物為代表，當然也包括部分真菌、藻類和原生生物，絕大多數只有1萬5到1萬9大小；
向大基因組進化主要以高等植物為代表，當然也包括部分低等真核生物，大小在20萬到200萬。
這下就麻煩了，別說林奈分類法都失效了，連基因組都朝兩個方向跑了，按照科學家們執拗的相信內共生是發生在一個祖單核生物中，那么，這二者必然有根本性聯系。
但是放在生物學里，這是災難。因為基因組太懸殊，無論是計算保守性還是對比都成了問題，未來隨著數據越來越多（主要是物種數據）以及算法的提高（依賴做CS的人們了），肯定會取得進步。
03，科學家一直在努力
另外，科學家一直沒有放棄治療，額，放棄尋找無線粒體真核生物的存在。因為，理論上，是存在的。
幾年前，Cell子刊Current Biology發表了一篇文章，首次發現無線粒體的真核生物，也許這是未來給我們揭秘線粒體內共生時間的一把鑰匙。
類單鞭滴蟲屬（Monocercomonoides）進行研究，該單細胞生物來自南美洲栗鼠的消化道。長期以來研究人員認為類單鞭滴蟲屬的線粒體已消失，為了驗證此觀點，他們對類單鞭滴蟲屬進行了基因組測序，結果并沒有發現線粒體基因的跡象，進一步研究發現，這種生物缺乏所有線粒體功能的關鍵蛋白。Karnkowska 說，“真核細胞的定義是有線粒體，如今我們的研究結果推翻了這個定義。”
Karnkowska A, Vacek V, Zubá?ová Z, et al. A Eukaryote without a Mitochondrial Organelle[J]. Current Biology, 2016.
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