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藥物靶標不停留器官層級,首次在全身尺度解析藥物結合單細胞圖譜

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隨著科研人員對生物系統的理解達到單細胞和高空間分辨率,藥理學方法也必須跟上,以匹配這種精確度,理解藥物作用。

目前,常用的臨床檢測只能顯示藥物在某個器官里大致濃度,但無法看清藥物真正結合在哪些細胞上。打個比方來說,藥物在體內的去向常像被霧霾遮住的景象——一切都處在模糊的感知中,想要精確定位并不簡單。

這種處在黑箱之中的現狀被終結了。以美國斯克里普斯研究中心(Scripps Research)與霍華德·休斯醫學研究所(Howard Hughes Medical Institute)為主的研究團隊開發了一種突破性的成像技術,能夠照亮整個小鼠體內藥物結合的單個細胞。

相關研究內容以「Mapping cellular targets of covalent cancer drugs in the entire mammalian body」為題,于 2025 年 12 月 22 日發布在《Cell》。



論文鏈接:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(25)01365-0

vCATCH

體積清除輔助組織點擊化學(volumetric clearing-assisted tissue click chemistry),后稱為 vCATCH,是該團隊所開發的能夠在體內精確定位藥物、細胞結合情況的成像技術。



圖示:建立深層組織點擊反應的原理。

vCATCH 是對 2022 年提出的 CATCH 方法的升級方向,主要采用以下幾種關鍵技術的組合:

  • 體內部位標記藥物分子:將包含可與目標蛋白發生共價作用的過量的銅進行適當的化學改造,以深入染色器官。
  • 體內給藥與固定:藥物按常規方式給藥后,在體內與目標結合。隨后對整個動物組織進行取樣與預處理。
  • Click Chemistry」反應標記結合位點:使用高選擇性的化學反應給結合了藥物的細胞分子進行熒光標記。該反應極具專一性并能穿透深層組織。
  • 體內組織清晰化 + 三維成像:通過組織清晰化方法讓整個組織透明,并使用光片熒光顯微成像系統獲全身三維數據。
  • AI 輔助圖像分析:成像產生的數據通常以「TB 級」規模呈現,使用先進的 AI 數據管線自動識別并定位每一個結合細胞。

測試與結果

為了測試這一新方法,葉的實驗室繪制了兩種靶向癌癥藥物的結合:用于治療血癌的 Ibrutinib(Imbruvica)和用于非小細胞肺癌處方的 Afatinib(Gilotrif)。

對于前者,vCATCH 分辨出的結合定位顯示不僅在血液細胞中,還在心臟、血管壁甚至肝臟的免疫細胞中出現明確結合信號,這一發現可能解釋其臨床上觀察到的心血管副作用



圖示:vCATCH 顯示了全體 TKI 分布,具有高空間分辨率。

而對于后者,表現出了如預期結果中的一致性。

除此之外,團隊還發現:盡管這兩種藥物都與腎臟結合,但它們在器官內表現出不同的模式。更高分辨率的 vCATCH 顯示了它們在器官內分布上的差異:Afatinib 在肝組織中表現出冠狀信號,而 Ibrutinib 則與稀疏散布的單個細胞相關,這一點由光片和共焦成像均有體現。



圖示:藥物富集組織中 TKI 參與的細胞類型特征。

藥物開發的全新視角

傳統藥效評估局限于整體組織層級,而 vCATCH 提供了逐細胞的藥物結合情況,有助于識別藥物靶標之外的非預期結合位點,這正是許多未知副作用的根源。

在藥物開發的早期階段,研發團隊可以憑此快速觀察到藥物與細胞的交互,也可以從 vCATCH 處獲得有關副作用的細胞級別解釋。結合 AI 工具分析全身結合數據后,甚至可以對不同小鼠個體乃至未來人體樣本執行比對分析,在個性化醫學中具備潛在應用。

相關報道:https://www.eurekalert.org/news-releases/1110881

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