內源逆轉錄病毒(ERVs)及其他內源性病毒元件,是古代生殖系感染的遺留物,占人類基因組的15%。大多數人類ERV(HERV)位點因突變、缺失和重組事件而失去功能。但HERV-K是最晚整合、轉錄活性最強、完整性最高的β逆轉錄病毒類HERV家族,約100個拷貝,多數保留完整Gag/Pol/Env開放閱讀框;人工重構的祖先HERV-K基因組可在體外產生感染性病毒顆粒。HERV-K包膜糖蛋白(Env)表達異常已被認為與癌癥和神經退行性疾病有關。針對HERV-KEnv的自身抗體已在多種自身免疫疾病患者中被發現。近期科學家們,通過X射線晶體學解析分辨率2.25?的HERV-K(HML-2)包膜糖蛋白表面亞基受體結合區(SU)原子結構,闡明了其分子折疊、糖基化、配體結合特征,該研究成果已發表至《Journal of Virology》雜志,題為“Crystal structure of HERV-K envelope glycoprotein surface subunit”。
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Env蛋白基礎結構為I型融合前體蛋白,切割為表面亞基SU(受體結合區)、跨膜亞基TM(膜融合區)。此前發表的文章僅揭示了Env三聚體SU-TM冷凍電鏡結構,缺少高分辨率SU單體原子模型,無法精細解析糖基化、小分子結合位點、抗原表位;本研究利用共識序列HERV-KCON構建SU,獲得2.25?晶體結構,該結構提供了HERV-K中最可能觸發自身免疫反應的分子組分的原子層面視圖,并識別出類藥物分子和細胞表面多糖的潛在結合位點,為進一步揭示HERV-K與腫瘤、神經退行性疾病、自身免疫病的關聯機制,研發靶向藥物、自身免疫抗原表位提供原子層面研究基礎。
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