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兒子離世3年后,這位父親終于用AI查清了那個“無形兇手”

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作者: 邵楚芮

來源: Vista看天下

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當研發能力不再稀缺,真正稀缺的便成了精力和動機。

文|邵楚芮

欄目|Vista天下奇點

AI已經能幫一位失去孩子的父親找到“兇手”了。而且,這位父親只花了幾天時間。

2021年9月23日,丹尼爾·麥金農的長子歐文,在美國科羅拉多州出生了。麥金農與他的妻子維多利亞·弗萊都沉浸在迎接新成員的喜悅之中。但幾小時后,情況急轉直下。

歐文的鼻翼急促翕動,血氧讀數毫無征兆地往下掉。他的身體進入短暫的穩定期,卻又在1個月后突然惡化。

歐文在世時,包括全美最好的遺傳學實驗室,都沒能確診他的病因。直到孩子離世、做完尸檢,病因才水落石出。


圖源:麥金農博客

3年后,麥金農即將迎來第二個孩子。這一次,他沒再等專家。他要回了所有檢測數據,自己開發了一個AI系統,不僅確認了第二個孩子的健康,還獨立復現出了當年奪走歐文生命的那個“元兇”——一段DNA。

奪走歐文的那段變異,是先天的、在胎兒期就已寫定的。麥金農搭建的系統能做的,是在妊娠階段就分析出這種已知的隱患。這意味著,地中海貧血、脊髓性肌萎縮癥等一大類先天罕見病,理論上都能用這套方法提前發現、提前預防。

2026年5月,谷歌DeepMind旗下專做AI藥物研發的Isomorphic Labs,剛拿下一輪21億美元的融資,目標是用AI“解決所有疾病”。整個醫療AI賽道,大公司動輒就是幾十億美元的投入。


Isomorphic Labs(圖源:官網)

而麥金農曾是一名產品經理,先后在Facebook、谷歌和Meta任職。為什么一個前大廠打工人,能用業余時間做出頂尖實驗室沒交付的東西?AI在醫療領域的應用,已經在什么階段了?

01


一場措手不及的告別

歐文的一生只有8周,其中的大半時間都在ICU里度過。

麥金農在博客中寫道,出生當天,歐文的血氧飽和度就一路下滑,醫生立即進行了氣管插管,并呼叫直升機將他轉送至科羅拉多兒童醫院。

到達兒童醫院時,歐文已經穩定下來了。“沒什么好擔心的?!贬t護人員對麥金農一家說。

但幾周后,一次常規的換藥操作,引發了歐文的肺部疾病,讓他的血氧再次暴跌,臉色發青,只能靠體外膜氧合器(ECMO)來維持生命。

醫療團隊懷疑,歐文患有一種叫做“肺泡毛細血管發育不良(ACD)”的致命疾病。


歐文(圖源:麥金農博客)

ACD無法被肉眼看見,其病灶藏在肺部那套負責氣體交換的微觀結構里?;歼@種病的孩子,通常在出生頭兩天就出現呼吸窘迫和嚴重的肺動脈高壓,多數熬不過出生后的第一個月,死于呼吸衰竭。

過去要確診ACD,得開胸取一塊肺組織做活檢。直到2009年,波蘭裔科學家帕維爾·斯坦凱維奇找到了它的遺傳成因,確診才變得“溫和”了一些,理論上,只需要一次口腔拭子。

麥金農夫婦把歐文的樣本送去了全美最好的遺傳學實驗室,做全基因組測序?!斑@是新生兒重癥監護診斷的‘黃金標準’?!丙溄疝r寫道。

但兩周后,麥金農夫婦空手而歸。實驗室的化驗結果一無所獲,歐文似乎并沒有ACD。

“我們仍然抱有治愈的希望,”麥金農說,“但接下來的4周,希望一點點破滅?!贬t院換了一種又一種治療方案,但歐文始終沒有好轉。

歐文出生8周后,麥金農夫婦做出了“這輩子最艱難的決定”,與歐文告別。


圖源:《你好,兒科醫生》海報

2018年發表的醫學論文中指出,ACD大約在每10萬到20萬個活產新生兒里,才出現1例。但根據近年的研究,這個數字很可能被低估了。因為大約九成的ACD病例,在生前根本沒被識別。它“看起來這么罕見”,一部分原因恰恰是它太難被發現。

麥金農一家也是如此。直到歐文離世、做完肺活檢后,病理結果才終于確認,歐文患的是ACD。

02


用AI確認“兇手”的存在

在與歐文告別之前,麥金農一家就曾找過2009年發現ACD遺傳成因的那位科學家,斯坦凱維奇。他們希望這位最懂這種病的人,能幫忙重新看一看歐文的基因組?!叭绻覀兇_切地知道毫無希望,或許更容易接受這個事實。”麥金農寫道。

但斯坦凱維奇無法做出這樣的判斷。據麥金農描述,重新分析基因組非常耗時耗力。而斯坦凱維奇的實驗室,收到的是來自全世界絕望家庭的求助。他必須把有限的精力,投給那些他判斷自己最可能真正幫上忙的病例。

斯坦凱維奇提出,需要先有歐文病理確診ACD的證據,他才有把握分析。


圖源:網絡

歐文去世后,夫婦倆做了肺組織活檢。病理學家清楚地看到了ACD特有的肺泡壁增厚和紊亂的循環結構。有了這份確診證據,斯坦凱維奇才接過歐文的基因組,并最終揭開了謎底。

歐文的基因組里,缺失了一段長約91千堿基(91kb)的DNA。這段DNA本身并不是一個基因,而是一個“增強子”。它可以把一個叫FOXF1的基因的表達調高,讓肺正常發育。

一個細微到以“千堿基”計量的缺失,就是奪走歐文生命的“兇手”。“我們如釋重負,也心碎不已?!丙溄疝r在博客中寫。

“如釋重負”,是因為折磨了他們這么久的為什么,終于有了答案。而心碎,是因為這個答案,本來在妻子懷孕階段就可以提前知道。如果當初查出來了,他們、醫院工作人員和歐文,都不必白白熬過那8周,甚至不必忍受懷胎9月的艱辛。


正常肺泡與ACD肺泡對比圖(AI生成)

答案不是無法獲得,只是來晚了。

但麥金農與妻子弗萊都渴望擁有一個家庭。據麥金農所述,2024年,在“無數次基因檢測、領養培訓和6輪試管嬰兒”后,他們迎來了次子沃倫。

但在孕期第16周,超聲檢查又出現了異常。在完成羊膜穿刺術和產前全基因組測序后,結果和3年前一樣一無所獲。

“我的心碎已經超越了絕望的階段,我決心要做些什么?!丙溄疝r說。于是,他聯系了所有合作過的實驗室,把全部基因組原始數據一份份要了回來?!拔乙约赫业酱鸢浮!?/p>

作為一位AI產品經理,他用Claude Code等前沿大模型,自己“Vibe Coding(氛圍編程)”,結合數據和專家的經驗,搭建了一套能夠進行臨床遺傳分析的AI系統。


圖源:《黑客帝國》

短短幾天時間,這個系統不僅確認了弗萊腹中的沃倫是健康的,還發現了當年奪走歐文生命的基因突變。沃倫出生后證明,AI的分析結果沒有問題。

對麥金農來說,這意味著這套工具的價值已經超出了家庭范圍。它不僅能回答自己的疑問,也可能幫助那些長期徘徊在“無診斷”狀態中的患者及家屬。

此后,麥金農創立了一家公司Gamow Labs。據公司官網介紹,在一項盲法研究里,面對66例曾被多家臨床實驗室判定為“無診斷”的ACD病例,他們的系統全部找出了分子層面的解釋,還破解了2例多年懸而未決的病例。


圖源:Gamow Labs官網

連麥金農自己都覺得不可思議,一個用AI這么快就搭出來的東西,憑什么能跟全美最頂尖的實驗室,跑出同樣,甚至更好的結果?

03


稀缺的從來不是能力

在臨床基因組學里,真正貴、真正難的,并不是測序本身。

測序這道工序的降價幅度以數量級計。但真正降不下來的,是測完之后的解讀。一份2021年的研究指出,一個病例平均有約100個變異基因需要審讀,折算下來,每位病人要耗去專家50到100個小時。而現實里,醫生常常每個病例只來得及看大約10個變異基因。

基因數據分析公司QIAGEN在分析報告中指出,盡管專家鑒定的準確率比AI高,但如今,需要審核的遺傳數據已經爆炸式增長,僅靠專家鑒定遠遠不夠。


圖源:QUAGEN官網

所以問題的關鍵,從來不是專家愿不愿意幫忙,而是專家根本分身乏術。

但站在患者及其家屬這一邊,稀缺的專家時間讓他們飽受折磨。答案一直都在那段數據里,只是沒人騰得出手去分析它。

而AI真正降低的,就是這個分析門檻。

這并非孤例。在解讀基因組這件事上,AI這幾年已經輔助醫生工作。比如,在不少基因檢測病例中,研究人員會發現可疑的DNA變異,卻無法判斷它究竟是否致病,即“意義未明變異”(VUS)。人類目前已觀察到約400萬個錯義變異,但其中僅約2%被明確歸類為“致病”或“良性”,其余絕大多數仍缺乏可靠的臨床分類。

為了解決這一難題,谷歌DeepMind于2023年推出了AI模型AlphaMissense。它借鑒了AlphaFold的蛋白質結構建模思路,能夠對約7100萬種可能的人類錯義變異進行致病性預測,并將其中約89%歸類為“可能良性”或“可能致病”。


AlphaMissense 致病性預測(AI生成,數據來源:DeepMind團隊2023年論文中的示意圖)

這類工具并不能直接替代臨床診斷,但能夠幫助研究人員和臨床遺傳學家快速篩選海量候選變異,將有限的專家時間集中到最值得進一步驗證的目標上。

類似的事,也在中國發生。據《中國科學報》報道,一位23歲、信息管理專業的本科生馮睿洋,因為一位年紀相仿的親戚患癌,決定給自己做一次三代基因組測序。

她沒有經過系統生物信息學訓練,因此,在拿到原始測序數據后,她拉來AI當外援。馮睿洋把數據傳上云存儲,租服務器跑自動化流程,把十幾種開源生物信息工具串在一起。最后,她花500元就得到了商業機構報價2萬多元的數據分析,且分析得更加深入。

她在自己的基因里翻出了紅綠色盲隱性基因、藥物代謝特征,也找到了與親戚癌癥相關的“嫌疑突變”。還有浙江大學的研究員希望得到她的罕見樣本信息。


馮睿洋和AI的合作過程(圖源:中國科學報)

“我敢直接開干,是因為測序結果的解讀是一個相對固定的步驟,相關方法和工具都已經公開,自己可以通過與AI合作和相關學習,完成這些操作?!瘪T睿洋說。

雖然專家能夠更好地運用其專業知識和經驗,對基因組做出細致入微的判斷,但AI讓解讀基因組的那種能力,從“極度稀缺”,變成可以被批量供給的東西。

而當研發能力不再稀缺,真正稀缺的便成了精力和動機。

麥金農能把這件事做成,是因為他是一個失去了第一個孩子,不愿再失去第二個的父親。

測序會更便宜,AI模型會更聰明,基因解讀也會越來越高效。但在許多技術突破背后,真正的起點往往不是技術,而是一個具體的人生難題。

參考資料:

1.Daniel D. McKinnon.Vibe coding my way to a healthy family: Introducing Gamow Labs.https://www.ddmckinnon.com/category/tech/Gamow 2. 2.Labs.https://gamowlabs.com/index.html

3.QIAGEN Digital Insights.Expert-curation vs. Artificial intelligence for variant classification: Which approach is better for clinical genetic testing labs.https://digitalinsights.qiagen.com/news/blog/clinical/expert-curation-vs-artificial-intelligence-for-variant-classification-which-approach-is-better-for-clinical-genetic-testing-labs/

4.Jun Cheng et al.Accurate proteome-wide missense variant effect prediction with AlphaMissense.Science381,eadg7492(2023).DOI:10.1126/science.adg7492

5.Minton, K. Predicting variant pathogenicity with AlphaMissense. Nat Rev Genet 24, 804 (2023). https://doi.org/10.1038/s41576-023-00668-9

6.中國科學報,23歲女生大膽“跨界”,“手搓”出自己的基因檢測報告,2026.5

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